سیستم همکاری در فروش سپیده

n       سطح بیان mRNA اغلب بیان گر میزان پروتئین فعال در یک سلول نمی باشد.

n       توالی ژنی بیان گر تغییرات و اصلاحات پس از ترجمه ی پروتئین ها و فعالیت آنها نمی باشد.

n       مطالعه ی ژنوم مراحل دینامیک سلول را  بیان نمی کند و با داشتن یک توالی ژنومی لزوماً نمی توان به فعال بودن یا نبودن پروتئین حاصل از آن پی برد. 

n       محدود بودن منابع پروتئینی

n       تنوع زیاد گونه های پروتئینی

 پیرایش رونوشت های ژنی

تغییرات شیمیایی پس از ترجمه

n       تفاوت در مقدار پروتئین ها

n       تفاوت محتوای پروتئومی از سلولی به سلول دیگر

n       پروتئومیک بیانی (Expressional or Analytical Proteomics)

n       پروتئومیک نقشه فیزیکی (Functional or Interaction Proteomics)

n       پروتئومیک ساختاری (Structural Proteomics)

n       الکتروفورز دوبعدی (Two Dimensional gel Electrophoresis (2 DE))

n       طیف سنجی جرمی (Mass Spectrometry (MS))

n       تراشه های پروتئینی (Protoin chips)

n       انگشت نگاری جرمی پپتیدها (Peptide mass fingerprinting)